Десять лет назад, 9 марта 2004 года, в соответствии с Концепцией административной реформы в Российской Федерации Указом Президента Российской Федерации была утверждена новая для России трехзвенная система федеральных органов исполнительной власти, включающая федеральные министерства, федеральные службы и федеральные агентства. Согласно этому указу организовано и Федеральное агентство по недропользованию, которому были переданы «правоприменительные функции, функции по оказанию государственных услуг и по управлению имуществом в сфере недропользования Министерства природных ресурсов Российской Федерации».
17 июня 2004 года вышло в свет постановление Правительства Российской Федерации: «О Федеральном агентстве по недропользованию», которым были конкретизированы полномочия Агентства, утверждено положение об Агентстве, определена структура его аппарата и штатная численность.
Все это дало возможность оперативно сформировать аппарат, решить организационные и финансово-хозяйственные вопросы.
С 17 июня 2004 года Федеральное агентство по недропользованию, получившее официальное сокращенное название «Роснедра», приступило к исполнению возложенных на него функций.
В поздравлении, направленном в адрес коллектива центрального аппарата и территориальных органов Роснедр от имени Министра природных ресурсов и экологии С.Е.Донского, в частности, говорится: «Все эти 10 лет высокий профессионализм, глубокие знания, преданность делу являлись отличительной чертой сотрудников Роснедр. Работа, которую вы делаете сегодня, имеет большое значение для геологической отрасли, служащей прочной основой социально-экономического развития страны, способствующей укреплению целого ряда отраслей производства и поддержанию авторитета России, как мощной энергетической державы».
С.Е. Донской отметил, что в настоящее время геологическая отрасль находится на подъёме, о чем свидетельствует значительный рост инвестиций недропользователей в разведку и добычу полезных ископаемых: «Уверен, что данная тенденция во многом связана с успешной реализацией Роснедрами мероприятий в рамках Программы воспроизводства минерально-сырьевой базы», - подчеркнул глава Минприроды России.